深圳2022年4月29日 /美通社/ -- 2021年底,承啟生物首席科學家、暨南大學張弓教授當選國際人類蛋白質組計劃執(zhí)行委員會常務委員,這是目前在這一國際大型合作項目中,中國人任職的最高職位。與此同時,張弓教授還被任命領導8號染色體編碼蛋白質的研究,加上此前暨南大學何慶瑜教授已被任命領導20號染色體編碼蛋白質的研究,至此,暨南大學承擔了中國大陸三分之二的蛋白質研究任務,成為中國人類蛋白質組計劃的最大承擔單位。
國際人類蛋白質組計劃執(zhí)行委員會常務委員、承啟生物首席科學家、暨南大學教授張弓
以多項領先科研成果 在全球學術舞臺上發(fā)出"中國聲音"
蛋白質是組成人體一切細胞、組織的必要成分,是生命活動的實際承擔者。在人類基因組計劃完成后,人類基因組各基因及其功能都有待在蛋白質層面予以揭示和闡明。事實上,蛋白質組比基因組復雜得多。據專家估計,人類基因組上約2萬個基因可變化出高達數百萬種蛋白質形體(Proteoforms),因此系統(tǒng)性研究人類蛋白質組勢在必行。為此,國際上成立了人類蛋白質組計劃(Human Proteome Project, HPP),這是人類基因組計劃之后的又一大型國際科學合作項目。2012年,"染色體中心的人類蛋白質組計劃(CHPP)"作為HPP的核心正式啟動,其主要目的是鑒定所有人類蛋白質,迄今為止仍在進行中。
此次,張弓教授被任命為國際人類蛋白質組計劃執(zhí)行委員會常務委員,表明中國關于人類蛋白質的研究已躋身世界前列,并獲得國際學術界的高度認可,徹底掌握該領域的核心話語權。
事實上,此次張弓教授的當選絕非偶然,自2013年開始,張弓教授就和其他中國科學家一起,在人類蛋白質研究領域中不斷發(fā)出中國聲音。
HUPO2014大會上,張弓教授與國際人類蛋白質組計劃的發(fā)起人Young-Ki Paik(韓國延世大學教授)在完成翻譯組學的特邀報告后合影
2013年,張弓教授團隊研發(fā)成功翻譯組測序技術,并與王通教授、何慶瑜教授研究組一同提出,翻譯組測序可以為蛋白質組質譜解析提供獨立而精密的參考信息,從而極大提高解析蛋白質組的能力。該技術于2014年被作為CHPP的核心支柱之一,并在同年被人類蛋白質組組織列為國際人類蛋白質組計劃的首要突出貢獻;
2018年,張弓教授等人在核心生物期刊Nucleic Acids Research(《核酸研究》)上發(fā)表了目前最全的翻譯組學數據庫TranslatomeDB,該數據為蛋白質組研究提供了重要的參照資源和獨立質控數據源;
2019年,張弓教授、王通教授、何慶瑜教授研究組通過翻譯組測序和蛋白質組質譜技術,發(fā)現了數千個此前被認為的"非編碼RNA"實際上可翻譯出蛋白質。該研究系統(tǒng)性地重新注釋了人類基因組,打開了一個全新的人類"暗蛋白質組"世界,也為研究各種重大疾病的機制、研發(fā)新型診斷和治療方法探索出了更多可能。
翻譯組(RNC-mRNA)被作為國際人類蛋白質組計劃的核心支柱之一。Reprinted with permission from J. Proteome Res. 2014, 13, 1, 50–59. Copyright 2014 American Chemical Society.
由于其突出貢獻,張弓教授被推選為2022-2024年CHPP新一屆執(zhí)行委員會常委。此次張弓教授在國際舞臺上榮膺國際人類蛋白質組計劃執(zhí)行委員會常務委員,亦是對其在過去10年不斷在翻譯組測序技術和蛋白質組質譜技術相關領域的肯定。未來,在以張弓教授為首的中國科學家?guī)ьI下,中國的人類蛋白質研究還將取得更多新突破,為解密人體的"健康密碼"貢獻更多力量。
以技術創(chuàng)新破局 促推行業(yè)發(fā)展
在學術研究者的身份之外,張弓教授的另一個身份是承啟生物的聯(lián)合創(chuàng)始人,在其帶領下,承啟生物也不斷為國際人類蛋白質組計劃貢獻企業(yè)力量。
作為一家致力于用基因科技為人們提供精準醫(yī)療及健康管理服務的科技公司,承啟生物建立了極為豐富的翻譯組學研究,是目前僅少數能提供多物種翻譯組測序及分析,并掌握著一系列翻譯組測序技術專利的公司,得益于此,2017年,承啟生物宣布為國際人類蛋白質組計劃免費提供翻譯組測序服務,助力國際人類蛋白質組計劃早日完成。
張弓教授受邀在HUPO2017大會上作關于發(fā)現人類“暗蛋白質組”的專題報告,并在會上宣布承啟生物將為國際人類蛋白質組計劃免費提供翻譯組測序服務
自2022年起,國際人類蛋白質組計劃的官方數據庫neXtProt的亞洲分站也由承啟生物建設、運營和維護。這是國際人類蛋白質組計劃第一次將官方數據庫交由亞洲公司運維,需要團隊具備海量組學數據的精準處理能力和超大型生物信息數據庫的運維能力。最終,選由承啟生物作為該數據庫的承接者,對于中國在國際人類蛋白質組計劃中核心地位的提升具有重大意義。4月,位于瑞士的neXtProt數據庫團隊開始向承啟生物同步現有數據。
如果說,張弓教授是承啟生物的主心骨,那么其原創(chuàng)的"中國造"FANSe算法就是承接HPP官方數據庫建立的基石。FANSe系列核酸測序算法是迄今為止穩(wěn)健性和準確性最高的比對算法,同時具備很高的容錯性,被CHPP指定為核心支柱的推薦算法,可單機5分鐘分析完一個人全基因組測序數據集,刷新世界紀錄。FANSe算法另一個特性是全自主開發(fā),這使得其可移植性和擴展性幾乎沒有任何限制,可高效運行于全國產的計算機上,在目前國際貿易爭端形勢嚴峻的情況下,無論在軟件還是硬件層面,使用FANSe算法都不會被國外卡脖子。以FANSe算法為基礎,張弓教授團隊和承啟生物陸續(xù)成功研發(fā)了一系列高精度算法和實驗方案,橫跨核酸測序、蛋白質組、代謝組等,建立了完整的國產化全組學高性能、高精度分析體系,確保了中國精準醫(yī)學的精準與安全。
未來,承啟生物將繼續(xù)依托自身的技術優(yōu)勢和資源,將更多更創(chuàng)新的基因測序、翻譯組學、蛋白質組學等技術應用于臨床與科研,為全面解析人類蛋白質組貢獻一己之力,推動"以蛋白質組學驅動精準醫(yī)學"的發(fā)展。