中國團隊Nature重磅論文:新冠病毒或由穿山甲冠狀病毒與蝙蝠冠狀病毒重組產(chǎn)生
新冠病毒的“罪魁禍首”到底是誰?蝙蝠?穿山甲?
從新冠疫情爆發(fā)之初,到如今全球累計確診病例數(shù)逾 383 萬,這個問題仍然沒有確切的答案。
近日,我國研究人員給出了最新的答案:新冠病毒可能是由穿山甲冠狀病毒與蝙蝠冠狀病毒重組產(chǎn)生!
當?shù)貢r間 2020 年 5 月 7 日,來自華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院、嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室(包括其肇慶分中心)、廣州動物園、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院農(nóng)業(yè)生物技術(shù)國家重點實驗室及廣東省野生動物救護中心的研究團隊于國際著名期刊《自然》在線發(fā)表了題為 Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins(馬來亞穿山甲中新冠病毒相關(guān)冠狀病毒的分離)的論文。
到底是誰的鍋?
新冠病毒的中間宿主可能是蝙蝠
疫情期間,我們最不該覺得陌生的一串英文無疑是新冠病毒的國際通用名稱 SARS-CoV-2。
雷鋒網(wǎng)此前報道過,國際范圍內(nèi)病毒的命名均由國際病毒分類委員會負責,此次肆虐全球的新冠病毒之所以被國際病毒分類委員會命名為 SARS-CoV-2,原因就在于新冠病毒 SARS-CoV-2 與多年前的“非典”病毒 SARS-CoV 之間的關(guān)系—;—;二者存在明顯區(qū)別, SARS-CoV-2 有其新穎性,但同時二者屬于同一類型,具有親緣性。
早在新冠疫情爆發(fā)之前,相關(guān)研究人員就發(fā)現(xiàn),當年的“非典”病毒 SARS-CoV 毒株源自蝙蝠。
那么順著這條思路,作為“非典”病毒的親戚,新冠病毒的罪魁禍首會不會也是蝙蝠呢?
早在當?shù)貢r間 2020 年 1 月 23 日,中科院武漢病毒所石正麗團隊就在預(yù)印本網(wǎng)站 bioRxiv 上發(fā)表論文指出,新冠病毒的中間宿主可能是蝙蝠。
具體來講,該團隊從 5 名患者體內(nèi)獲得了 SARS-CoV-2 病毒的全基因組,發(fā)現(xiàn)這 5 例基因組基本上一致。SARS-CoV-2 在整個基因組中與在云南中華菊頭蝠身上檢測到的冠狀病毒 Bat-CoV-RaTG13 有 96.2% 的一致性,與 SARS-CoV 有 79.5% 的一致性。
經(jīng)過同行評議后,該論文隨后于當?shù)貢r間 2020 年 2 月 3 日正式發(fā)表于《自然》期刊。
新冠病毒的中間宿主可能是穿山甲
然而,科學(xué)的魅力就在于不斷探索、提出新發(fā)現(xiàn),推翻或是印證前人的觀點。
2020 年 2 月 7 日,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)針對新型冠狀病毒肺炎疫情研究攻關(guān)情況舉行了新聞發(fā)布會。會上,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)、嶺南現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學(xué)與技術(shù)廣東省實驗室沈永義、肖立華等科研人員表示,穿山甲可能為新冠病毒的潛在中間宿主。
據(jù)了解,該團隊這一結(jié)論的得來過程,主要分四步:
首先,通過分析 1000 余份宏基因組樣品,確定穿山甲為潛在中間宿主;
其次,通過分子生物學(xué)檢測,揭示穿山甲中 β 冠狀病毒的陽性率為 70% ;
隨后,進一步對病毒進行分離鑒定,在電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結(jié)構(gòu);
最終,通過對病毒的基因組分析,發(fā)現(xiàn)分離的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達 99% 。
在這之后,由頂尖病毒學(xué)家管軼領(lǐng)銜的研究團隊,再次證明穿山甲是新冠病毒的中間宿主—;—;2020 年 2 月 18 日,香港大學(xué)管軼團隊與廣西醫(yī)科大學(xué)胡艷玲團隊在預(yù)印本網(wǎng)站 bioRxiv 上發(fā)表了題為 Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China(中國南方馬來亞穿山甲中 2019-nCov 相關(guān)冠狀病毒的鑒定)的論文。
根據(jù)雷鋒網(wǎng)(公眾號:雷鋒網(wǎng))當時的報道,研究人員共對三批穿山甲樣本進行了分析與研究—;—;2017 年 8 月-2018 年 1 月廣西海關(guān)在反走私行動中查獲的 18 個冷凍穿山甲的(肺、腸、血液)等 43 個組織樣品;2018 年 5-7 月的 12 只穿山甲的 19 個樣本(9 個腸組織、10 個肺組織);廣州海關(guān)技術(shù)中心在 2019 年 3 月反走私行動中查獲的 5 個歸檔穿山甲樣品(2 個皮膚拭子、1 個不明組織、1 塊鱗片)。
結(jié)果表明:
在穿山甲樣本中發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒 Pangolin-CoV 基因組與 SARS-CoV-2 基因組的相似率為 85.5%-92.4%;
SARS-CoV-2 與 Pangolin-CoV 受體結(jié)合域的氨基酸序列相似性高達 97.4%,而與 Bat-CoV-RaTG13 受體結(jié)合域的氨基酸相似度僅 89.2%;
Pangolin-CoV 和 SARS-CoV-2 在病毒受體區(qū)域的 5 個關(guān)鍵殘基上共享氨基酸,而 Bat-CoV-RaTG13 只與 SARS-CoV-2 共享一個氨基酸。
因此,相較于蝙蝠,穿山甲更有可能是新冠病毒的中間宿主。
同樣在經(jīng)過同行評議后,這一論文最終于當?shù)貢r間 2020 年 3 月 26 日正式發(fā)表于《自然》期刊。
新冠病毒或由兩種冠狀病毒重組產(chǎn)生
雷鋒網(wǎng)了解到,2003 年管軼團隊率先分離出 SARS 病毒,證實了果子貍為其中間宿主,也是人類感染 SARS 的直接來源,之后與鐘南山院士一起上報,對于當時疫情的遏制起到了關(guān)鍵性作用。
不過,雖然管軼教授在病毒學(xué)領(lǐng)域頗有建樹,但尋找新冠病毒源頭的過程并未就此畫上句號。
近日,由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)領(lǐng)銜的團隊在論文中再次給出了新答案。
具體來講,研究人員從 25 個馬來亞穿山甲樣本中的 17 個里分離得到一種冠狀病毒,即前文所述的 Pangolin-CoV,發(fā)現(xiàn):
Pangolin-CoV 的 E、M、N 和 S 基因與 SARS-CoV-2 的同源性分別為 100%、98.6%、97.8% 和 90.7%;
Pangolin-CoV S 蛋白內(nèi)的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域?qū)嶋H上與 SARS-CoV-2 的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域相同,僅具有一個非關(guān)鍵氨基酸差異。
上圖為 Pangolin-CoV 的基因組表征。
基于上述發(fā)現(xiàn),研究人員表示,SARS-CoV-2 可能源自Pangolin-CoV 與 Bat-CoV-RaTG13 的重組。
此外,研究人員也展示了經(jīng)由 Pangolin-CoV 誘發(fā)的穿山甲肺部可能出現(xiàn)的病理變化。
如下圖所示,a 部分為陰性(健康狀態(tài)),b、c、d 均為感染了 Pangolin-CoV 的狀態(tài),展示了肺泡上皮細胞和含鐵血黃素色素的增殖和脫屑現(xiàn)象,其中 c 有嚴重的毛細血管充血。另外,e 為肺組織雙膜囊泡的透射電子顯微鏡圖像,右上角清晰可見冠狀病毒。
實際上,論文也明確提到:
穿山甲是被販賣次數(shù)最多的哺乳動物,如果野生動物貿(mào)易得不到有效控制,未來其身上的冠狀病毒可能還將會對公眾健康構(gòu)成威脅。
雖然這一結(jié)論仍有可能不是最終的答案,但也為找尋新冠病毒的源頭提供了新的思路。期待“真理”早日浮出水面,這場疫情也盡快結(jié)束。
引用來源:
[1]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7
[2]https://scau.edu.cn/2020/0207/c1300a219015/page.htm
[3]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2169-0
[4]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2313-x