百奧智匯:致力挖掘單細胞大數(shù)據(jù)助力疾病診療
近年來,隨著測序技術(shù)的迅猛發(fā)展,單細胞測序技術(shù)已逐漸走入人們視野。2013年,單細胞測序技術(shù)成為《自然》評選的“Method of the Year”。大多數(shù)的基于NGS的基因檢測,都是在大量細胞宏觀水平上,對整個細胞群進行遺傳分析。單細胞測序技術(shù)則是在單個細胞的水平上,對其遺傳物質(zhì)進行檢測,從而從更精細的水平觀察突變?nèi)绾螀f(xié)同作用來驅(qū)動疾病。因而,相較于常規(guī)的基因檢測,單細胞測序可以獲得更為龐大的細胞遺傳信息。
但在單細胞測序領(lǐng)域,如何對這些龐大的細胞遺傳信息進行分析仍是一大難題。以免疫細胞T細胞為例,單細胞測序技術(shù)可以發(fā)現(xiàn)T細胞亞群、不同的T細胞狀態(tài)、不同細胞亞群的異質(zhì)性及其潛在效用。這些細胞信息都需要通過生物信息學(xué)工具進行分析、整合,才能充分發(fā)揮單細胞測序的優(yōu)勢,對龐雜的細胞遺傳信息進行更深入的了解。
百奧智匯致力于單細胞測序技術(shù)和生物信息技術(shù)研究,通過與醫(yī)院、科研機構(gòu)以及制藥公司合作,挖掘單細胞基因組學(xué)和生物信息學(xué)在人類疾病診斷和治療上的應(yīng)用。
“生物信息學(xué)+單細胞測序”賦能疾病診療
百奧智匯成立于2018年,創(chuàng)始人張澤民博士曾任羅氏生物信息部門首席科學(xué)家,在生物信息領(lǐng)域有著20多年的沉淀,同時他也是國際知名的腫瘤基因組學(xué)專家,擁有超過60多項美國專利和多項歐洲專利。
公司的核心團隊成員擁有基因組學(xué)、生物信息學(xué)、ICT以及投資等專業(yè)背景。此外,公司擁有中科院院士、北大終身教授在內(nèi)的科學(xué)顧問委員會為公司研究提供支持。委員會成員包括中國理論生物學(xué)、生物信息學(xué)和非編碼RNA研究的先驅(qū)學(xué)者陳潤生院士,陳院士曾參與人類基因組1%和水稻基因組工作草圖的研究。
單細胞測序技術(shù)應(yīng)用廣泛,對疾病診斷和治療、臨床試驗?zāi)酥僚R床前試驗都具有重要意義。例如,醫(yī)院往往具有珍貴臨床樣本,單細胞測序技術(shù)可以對這些樣本進行更深入的數(shù)據(jù)挖掘和分析,為疾病診斷、治療提供指導(dǎo)。以腫瘤為例,傳統(tǒng)的腫瘤基因研究往往把特定部位的腫瘤當做一個單一的組織,從而尋找疾病相關(guān)的基因突變,或者基因表達量的變化。而利用單細胞測序技術(shù)可以實現(xiàn)對腫瘤更深層次的理解,甚至超越現(xiàn)有人們對腫瘤研究的認知。
對于單細胞測序研究以及生物信息學(xué)分析,張澤民博士頗有心得。“腫瘤的組織不是單一的,而是內(nèi)部結(jié)構(gòu)極為復(fù)雜的混合體,在這個混合體中可能只有一些微量的個體細胞發(fā)生病變。”張澤民博士解釋道,“腫瘤微環(huán)境中具有異質(zhì)性的各種腫瘤細胞和免疫細胞,這些少量或者單個的細胞的病變從腫瘤組織層面來看是微小的,很可能被湮沒在大量其他細胞中,但在單細胞層面可能是巨大的變化。”