美利用人工智能發(fā)現(xiàn)新型抗生素 可以殺滅多種致病細(xì)菌
美國科研團(tuán)隊(duì)最近利用人工智能技術(shù)發(fā)現(xiàn)一種新型抗生素,它可以殺滅多種致病細(xì)菌,包括一些對所有已知抗生素都具耐藥性的細(xì)菌菌株。
發(fā)表在最新一期美國《細(xì)胞》雜志上的這項(xiàng)研究顯示,在培養(yǎng)皿中,這種抗生素分子可殺滅除綠膿桿菌之外的數(shù)十種細(xì)菌菌株,其中包括艱難梭菌、鮑氏不動桿菌和結(jié)核桿菌等耐藥性較強(qiáng)的細(xì)菌。在動物實(shí)驗(yàn)中,它也有效清除了小鼠體內(nèi)的耐藥性細(xì)菌。
美國麻省理工學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)出一種機(jī)器學(xué)習(xí)算法,可自動學(xué)習(xí)分子結(jié)構(gòu)并預(yù)測其性能。研究人員通過這種算法尋找使分子有效殺滅大腸桿菌的化學(xué)特征,訓(xùn)練材料為約1700種美國食品和藥物管理局批準(zhǔn)的藥物和800種生物活性不同的天然化合物。
接下來,研究人員利用訓(xùn)練好的算法對美國布羅德研究所藥物再利用中心的約6000種化合物進(jìn)行篩查,從中挑選出了一種具有強(qiáng)大抗菌活性的分子,其化學(xué)結(jié)構(gòu)與所有已知抗生素都不同。研究人員還發(fā)現(xiàn),該分子對人體細(xì)胞的毒性可能也比較小。
研究人員用這種分子治療感染了鮑氏不動桿菌的小鼠,結(jié)果顯示,24小時內(nèi)小鼠體內(nèi)這種耐藥性細(xì)菌被完全清除。研究人員還發(fā)現(xiàn),連續(xù)30天使用這種分子未使大腸桿菌對它產(chǎn)生耐藥性。相比而言,大腸桿菌在1到3天內(nèi)就對常用抗生素環(huán)丙沙星產(chǎn)生耐藥性。
麻省理工學(xué)院電子工程和計算機(jī)科學(xué)教授雷吉娜·巴爾齊萊說,這種機(jī)器學(xué)習(xí)模型在計算機(jī)中探索化學(xué)結(jié)構(gòu),具有成本低、時間短、范圍廣等特點(diǎn),是傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)方法無法實(shí)現(xiàn)的。
研究團(tuán)隊(duì)還利用這一模型對數(shù)據(jù)庫中超過1億個分子進(jìn)行篩查,僅3天就找到23個與現(xiàn)有抗生素結(jié)構(gòu)不同的候選化合物,其中8個在實(shí)驗(yàn)室中對5種細(xì)菌有抗菌活性。研究人員說,未來這一模型還有望用于設(shè)計新型抗生素和優(yōu)化現(xiàn)有的分子,如可設(shè)計靶向特定細(xì)菌,而不殺滅其他有益細(xì)菌的抗生素。