華大基因推出基于GPU加速的DNA定序服務(wù)

英偉達(dá)公司宣布，全球最大的基因組研究所華大基因正在推出一項(xiàng)服務(wù)，該服務(wù)讓世界各地的研究人員能夠以較低的價(jià)格在云端執(zhí)行下一代定序(NGS)生物信息學(xué)分析。

全新的“EasyGenomics ” 服務(wù)由位于中國深圳的華大基因提供，該項(xiàng)服務(wù)將直觀的用戶界面與華大基因自動(dòng)化的流水線分析、軟件以及工具相結(jié)合。它們與業(yè)內(nèi)最大的定序平臺(tái)集成在一起，為生物學(xué)家、生物信息學(xué)家以及最終為內(nèi)科醫(yī)生提供所需的全部內(nèi)容，使其能夠提交和收到DNA定序數(shù)據(jù)的自動(dòng)化分析。

英偉達(dá)GPU可加速處理大型DNA數(shù)據(jù)分析，與使用基于CPU的系統(tǒng)相比，能夠令處理時(shí)間從數(shù)日縮短至區(qū)區(qū)數(shù)小時(shí)。EasyGenomics由英偉達(dá)GPU加速，因而為全球研究人員大大擴(kuò)展了高級基因組研究功能的可用性，讓科學(xué)離低價(jià)可行的個(gè)性化藥品時(shí)代更近一步。

針對2012年Bio-IT World展會(huì)上符合資格要求的生物學(xué)家和生物信息學(xué)家，華大基因現(xiàn)在正在推出這項(xiàng)全新服務(wù)的有限免費(fèi)試用。如需了解更多信息或如需申請免費(fèi)試用，敬請?jiān)L問EasyGenomics網(wǎng)站。

華大基因副總裁方林(音譯)博士表示：“通過讓更多研究人員以更低的價(jià)格更輕松地加速DNA定序數(shù)據(jù)，我們希望能夠便于醫(yī)生在臨床診斷以及復(fù)雜的疾病研究中把運(yùn)用基因組作為醫(yī)療工作的一個(gè)可行的組成部分。GPU加速讓科學(xué)家能夠比以往更快地分析DNA定序數(shù)據(jù)，將所用的時(shí)間從五天縮短至短短五個(gè)小時(shí)。 在云端充分完成部署之后，我們預(yù)計(jì)EasyGenomics將在基因組研究領(lǐng)域中掀起革命。”

EasyGenomics云服務(wù)采用基于英偉達(dá)(NVIDIA) Tesla M2070和M2075 GPU的混合型計(jì)算系統(tǒng)，這些 GPU連同系統(tǒng)CPU一起為DNA定序數(shù)據(jù)分析加速。當(dāng)EasyGenomics服務(wù)充分完成部署時(shí)，華大基因計(jì)劃新增數(shù)以百計(jì)的英偉達(dá)Tesla GPU來對其進(jìn)行升級，屆時(shí)預(yù)計(jì)該服務(wù)將支持?jǐn)?shù)以千計(jì)的用戶。

英偉達(dá)公司Tesla事業(yè)部高級總監(jiān)Sumit Gupta表示：“由于定序成本的下降，今年或?qū)⒊蔀?,000美元基因組之年。我們很快將淹沒在基因組定序的海量數(shù)據(jù)當(dāng)中。華大基因的EasyGenomics服務(wù)利用GPU計(jì)算的處理能力來為科學(xué)家提供一條低價(jià)且簡單易用的途徑，使其能夠輕松解決這種全新的大型基因數(shù)據(jù)問題，讓我們能夠離有效而低價(jià)的個(gè)性化醫(yī)療更近一步。”

從植物與大腸桿菌到大熊貓，在對各種生命形式進(jìn)行基因組定序這方面，華大基因從事著開創(chuàng)性的工作，目的是開發(fā)出更好的藥物、改善醫(yī)療以及開發(fā)出基因更優(yōu)秀的食物。 華大基因總部位于中國深圳，在美國馬薩諸塞州坎布里奇和丹麥哥本哈根設(shè)有分支機(jī)構(gòu)，其目標(biāo)是讓最前沿的基因組科學(xué)得到普及。

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