一直以來,腫瘤學家們都希望,根據對組織切片的分析,預測一個腫瘤朝哪個方向發(fā)生突變,以便對癥下藥進行治療。
德國柏林沙利特醫(yī)院分子腫瘤病理學實驗室利用波茨坦大學哈索-普拉特納研究所(HPI) 5月14號正式投入運行的新型超級計算機進行癌癥病人基因組測序,進行基因分析,針對病人量體裁衣建立治療模型。這一超級計算機擁有1500個平行計算的CPU,內存30太字節(jié)(1012),外存200太字節(jié)。與常規(guī)的系統(tǒng)不同,待處理的數據不是放在硬盤上,而是在計算過程中全部放在內存上。這臺超級計算機有2太字節(jié)的內存專門用于存放數據,因此可采用全新的內存數據庫技術(In-Memory),使得數據處理速度提高了一千倍,這種類型的計算機目前世界上才只有三臺。以往,沙利特醫(yī)院分子腫瘤病理學實驗室委托院外企業(yè)做病人基因組測序,公司保證在90天內提交結果。用這臺計算機,在未來作基因分析幾分鐘也許甚至幾秒鐘就可完成。這樣就可大大縮短從做出診斷到開始治療的時間,一旦做出診斷,緊跟著就能制定出治療方案,從而也大大減少了腫瘤發(fā)生變化對療效的影響,使治療方案更精準。
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