助力精準(zhǔn)醫(yī)療，新華三為華西醫(yī)院打造基因測(cè)序“新武器”

四川華西醫(yī)院作為國(guó)家重要的醫(yī)學(xué)科研和技術(shù)創(chuàng)新基地，在中國(guó)最佳醫(yī)院排行榜(復(fù)旦版)的科研得分上連續(xù)12年名列全國(guó)第一，在Nature INDEX排行榜上，華西醫(yī)院名列全球第14位，中國(guó)第一位。在為長(zhǎng)期基因研究工作鋪平道路的實(shí)踐中，華西醫(yī)院著眼于提高基因數(shù)據(jù)的分析能力及優(yōu)化數(shù)據(jù)分析平臺(tái)的建設(shè)成本，攜手紫光股份旗下新華三集團(tuán)打造高性能計(jì)算平臺(tái)，充分發(fā)揮基因測(cè)序整體解決方案優(yōu)勢(shì)，全力支持精準(zhǔn)醫(yī)療業(yè)務(wù)和研究的開展。

效率與成本兼顧

新華三為基因測(cè)序定制高性能計(jì)算平臺(tái)

為進(jìn)一步提升基因測(cè)序的效率，華西醫(yī)院決定在已有全球領(lǐng)先的基因測(cè)序平臺(tái)上，配合精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)平臺(tái)的建設(shè)，側(cè)重于利用“超多核CPU+GPU”的強(qiáng)大算力，打造高性能計(jì)算平臺(tái)，既要能夠立竿見影地顯著提升基因測(cè)序和分析能力，還要控制好建設(shè)成本，提高資金的使用效率和平臺(tái)建設(shè)的延續(xù)性。在充分了解客戶業(yè)務(wù)場(chǎng)景，新華三集團(tuán)根據(jù)實(shí)際部署情況作出了針對(duì)性的方案設(shè)計(jì)對(duì)硬件組件、軟件環(huán)境和管理平臺(tái)進(jìn)行全面整合，在滿足性能的前提下，能夠顯著提高基因測(cè)序的效率。

強(qiáng)大內(nèi)核

支撐高性能計(jì)算平臺(tái)加速醫(yī)學(xué)成果轉(zhuǎn)化

新華三集團(tuán)采用4臺(tái)搭載8塊NVIDIA A100 GPU和2顆AMD EPYC 7742(一共128個(gè)核心、256個(gè)線程)處理器的H3C UniServer R5500 G5人工智能服務(wù)器打造出性能強(qiáng)大的高性能計(jì)算平臺(tái)，從CPU、GPU的算力調(diào)度與整合，到先進(jìn)的軟件和算法，為數(shù)十個(gè)科學(xué)家團(tuán)隊(duì)提供包括胚系變異檢測(cè)、體細(xì)胞變異檢測(cè)等場(chǎng)景的算力服務(wù)，全力支持科學(xué)家團(tuán)隊(duì)的科研工作，加速助力醫(yī)學(xué)成果的轉(zhuǎn)化。

· 多核異構(gòu)高性能：一直以來，計(jì)算能力是基因組分析的瓶頸，而使用GPU加速則可以突破這一瓶頸。新華三的高性能計(jì)算平臺(tái)結(jié)合使用AMD EPYC 7742的多核心計(jì)算能力和NVIDIA A100 GPU強(qiáng)大的并行分析能力，核心胖節(jié)點(diǎn)由10臺(tái)R8900 G3關(guān)鍵業(yè)務(wù)服務(wù)器組成胖節(jié)點(diǎn)集群來承載，領(lǐng)先的8CPU+8GPU均衡架構(gòu)，超過24TB大內(nèi)存空間，滿足HPC領(lǐng)域各種頂尖科研而帶來的海量和復(fù)雜計(jì)算對(duì)高算力的需求。

· 軟硬結(jié)合簡(jiǎn)部署：華西醫(yī)院高性能計(jì)算平臺(tái)所采用的R5500 G5服務(wù)器支持NVIDIA HGX A100 8-GPU模組，是首批入選英偉達(dá)認(rèn)證系統(tǒng)的服務(wù)器機(jī)型之一，可獲得英偉達(dá)NVAIE在內(nèi)的整個(gè)軟件堆棧的企業(yè)級(jí)支持，包括對(duì)開源代碼的支持，大大減輕再使用前針對(duì)業(yè)務(wù)場(chǎng)景的部署和前期環(huán)境搭建，可以滿足華西醫(yī)院兼顧效率和成本的要求。

· 智慧算力調(diào)度作業(yè)效率提高32%：新華三集團(tuán)以智能的傲飛高性能計(jì)算管理平臺(tái)——AI資源區(qū)分管理(AIOS)實(shí)現(xiàn)了整個(gè)HPC集群的集中管理和智能調(diào)度，使整個(gè)系統(tǒng)像一臺(tái)機(jī)器一樣，實(shí)現(xiàn)統(tǒng)一的監(jiān)測(cè)、管理、部署，顯著地提升系統(tǒng)維護(hù)效率，而且能夠采用圖形界面(GUI)的模式，更加簡(jiǎn)便和直觀地操作計(jì)算節(jié)點(diǎn)控制臺(tái)，精準(zhǔn)全面地呈現(xiàn)HPC集群的總體狀態(tài)。同時(shí)對(duì)HPC批量作業(yè)和AI容器作業(yè)進(jìn)行智能調(diào)度，作業(yè)效率提升32%。

高性能計(jì)算平臺(tái)為華西醫(yī)院的科學(xué)研究注入強(qiáng)大的動(dòng)力，發(fā)揮其在多模態(tài)組學(xué)數(shù)據(jù)分析和基因應(yīng)用等領(lǐng)域的學(xué)術(shù)優(yōu)勢(shì)，加速精準(zhǔn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)在醫(yī)學(xué)上的廣泛應(yīng)用。未來，新華三集團(tuán)將持續(xù)推進(jìn)“云智原生”戰(zhàn)略的深化，以內(nèi)生智能的智慧計(jì)算，夯實(shí)數(shù)字大腦底座，助推精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域更多科研突破，以數(shù)字化之力支撐國(guó)家高技術(shù)領(lǐng)域的長(zhǎng)遠(yuǎn)發(fā)展。