ImmunityBio與微軟擬用GPU算力對COVID-19關(guān)鍵蛋白結(jié)構(gòu)展開建模

新冠病毒疫情爆發(fā)后，許多國際研究團(tuán)隊都展開了潛在藥物的開發(fā)工作，而這顯然離不開大量的計算與建模工作。比如免疫療法初創(chuàng)企業(yè) ImmunityBio，正在與微軟的 Azure 云計算部門展開合作。借助 24 PetaFlops 的 GPU 算力，其得以相當(dāng)細(xì)致地對 COVID-19 的關(guān)鍵蛋白結(jié)構(gòu)展開建模，以研究新冠病毒是如何進(jìn)入人體細(xì)胞的。

上圖綠色部分為刺突蛋白的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)區(qū)域，紅色部分為 ACE-2 受體，兩者之間的結(jié)合，是導(dǎo)致新冠病毒感染的第一步。（圖自：ImmunityBio）

在 Auzre 云平臺強(qiáng)大算力的幫助下，新合作意味著他們能夠在幾天之內(nèi)（而不是單打獨斗要耗費(fèi)的數(shù)月時間），完成刺突蛋白的建模工作。

省下來的時間，意味著該模型可以更快地投入研究潛在疫苗和治療方法的科學(xué)家和研究人員手中，以盡快找到抑制病毒復(fù)制和防止其附著在人類 ACE-2 蛋白受體上的方法。

最簡單的一個設(shè)想，便是確保刺突蛋白無法與受體瞄準(zhǔn)連接。在新冠病毒自愈患者身上，其天然抗體已經(jīng)能夠做到這一點。

目前正在研發(fā)的疫苗，專注的也是同一件事。此外，許多治療方法都在尋求降低病毒感染新細(xì)胞、將其鎖住以阻斷體內(nèi)復(fù)制的可能性。

據(jù)悉，微軟與 ImmunityBio 的合作，涉及 1250 套英偉達(dá) V100 Tensor Core GPU 組件的陣列。

軟件巨頭將這些 GPU 用于 Azure 集群中的機(jī)器學(xué)習(xí)應(yīng)用，結(jié)合 ImmunityBio 現(xiàn)有的 320 套 GPU 集群，可專門對分子建模工作進(jìn)行調(diào)整。

合作取得的成果，將提供給研究 COVID-19 緩解和預(yù)防療法的研究人員，以推動更快、更有效的解決方案的到來。
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