全自動機(jī)器學(xué)習(xí)系統(tǒng)診斷COVID-19,無需人工輔助可極速完成
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(文章來源:前瞻網(wǎng))
新冠肺炎已在全球范圍內(nèi)傳播,許多地區(qū)的醫(yī)療資源不足??焖僭\斷COVID-19,發(fā)現(xiàn)預(yù)后差的高?;颊?,對早期預(yù)防和優(yōu)化醫(yī)療資源具有重要意義。
機(jī)器學(xué)習(xí)已經(jīng)被利用在許多領(lǐng)域,包括醫(yī)學(xué)影像的早期篩查和診斷。在新冠疫情的防治上,這項(xiàng)技術(shù)一樣能大展身手。一篇發(fā)表在預(yù)印本平臺medRxiv上的論文“A Fully Automatic Deep Learning System for COVID-19 DiagnosTIc and PrognosTIc Analysis”提出了一個全自動的深度學(xué)習(xí)系統(tǒng),用于COVID-19診斷和預(yù)后分析的常規(guī)使用計算機(jī)斷層掃描。
研究人員回顧性收集了來自7個省市的5372例CT圖像。首先,他們利用4106例CT圖像和基因信息對機(jī)器學(xué)習(xí)(DL)系統(tǒng)進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練,使其了解肺的特征。隨后,來自6個省市的1266名患者(924例COVID-19, 471例隨訪5+天;342人患有其他肺炎)參與了深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)的培訓(xùn)和外部驗(yàn)證。
該系統(tǒng)包括三個部分:肺自動分割、非肺區(qū)抑制、COVID-19診斷和預(yù)后分析。在這個DL系統(tǒng)中,涉及兩個DL網(wǎng)絡(luò):DenseNet121-FPN用于胸部CT圖像中的肺部分割,以及新的COVID-19網(wǎng)絡(luò)用于COVID-19的診斷和預(yù)后分析。
DL是一個層次神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)家族,旨在學(xué)習(xí)原始數(shù)據(jù)與期望臨床結(jié)果之間的抽象映射。將DL模型中的計算單元定義為層次,并將它們集成起來模擬人腦的推理過程。主要的計算公式是卷積、池化、激活和批處理規(guī)范化。
在4個外部驗(yàn)證集中,深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)在區(qū)分COVID-19與其他肺炎(AUC=0.87和0.88)和病毒性肺炎(AUC=0.86)方面表現(xiàn)良好。此外,深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)成功將患者分為高危組和低危組,兩組患者住院時間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(p=0.013和0.014)。在沒有人工輔助的情況下,深度學(xué)習(xí)系統(tǒng)會自動聚焦于異常區(qū)域,這些區(qū)域的特征與所報道的放射學(xué)發(fā)現(xiàn)一致。
該系統(tǒng)具有良好的診斷和預(yù)測性能,在不增加成本的前提下,對COVID-19的流行控制有一定的幫助。如果是疑似病人,幾分鐘內(nèi)就能獲得CT掃描。之后,該DL系統(tǒng)可用于預(yù)測患者有COVID-19的概率。如果患者被診斷為COVID-19,DL系統(tǒng)還可以同時預(yù)測其預(yù)后情況,這可以用來尋找需要緊急醫(yī)療資源和特殊護(hù)理的潛在高?;颊?。
更重要的是,該系統(tǒng)速度快,不需要人工輔助圖像標(biāo)注,提高了其臨床應(yīng)用價值和魯棒性。對于典型的病人胸部CT掃描,DL系統(tǒng)用于預(yù)測預(yù)后和診斷的時間不到10秒。
盡管這個DL系統(tǒng)具有良好的性能,但研究人員也提出,本研究仍存在一些局限性。首先,還有其他的預(yù)后終點(diǎn)事件,如死亡或進(jìn)入重癥監(jiān)護(hù)室,本研究沒有考慮這些事件。其次,重度COVID-19與輕度COVID-19的治療方法不同,因此,分別探討兩組COVID-19的預(yù)后有一定幫助。
深度學(xué)習(xí)為快速篩選COVID-19和發(fā)現(xiàn)潛在高?;颊咛峁┝朔奖愕墓ぞ?,這可能有助于優(yōu)化醫(yī)療資源,在患者出現(xiàn)嚴(yán)重癥狀前進(jìn)行早期預(yù)防。
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