英國基因組學公司利用AWS和Lifebit創(chuàng)建基于云的Covid-19研究環(huán)境
[]英國基因組學已與公共云巨頭亞馬遜網(wǎng)絡服務(AWS)和生物醫(yī)學數(shù)據(jù)處理公司Lifebit攜手合作,創(chuàng)建了與Covid-19相關(guān)的基因組研究平臺。
該項目的目的是“改變”基因組數(shù)據(jù)的使用方式,并將其提供給世界各地的醫(yī)學研究社區(qū),并將最初專注于與全球抗Covid-19冠狀病毒斗爭有關(guān)的數(shù)據(jù)分析任務。
英國基因組學是由衛(wèi)生和社會護理部成立的獨立實體,負責監(jiān)督100,000個基因組計劃,其目的是對患有罕見疾病和癌癥的NHS患者的100,000個基因組進行測序。
該項目收集的數(shù)據(jù)將用于Covid-19研究,同時該平臺也將及時用于從該數(shù)據(jù)中獲得見解,以幫助英國基因組學尋求更多有關(guān)稀有疾病和癌癥的信息。
除此之外,英國基因組學還將與重癥監(jiān)護死亡率遺傳學小組合作,該小組是一個全球醫(yī)生和科學家社區(qū),致力于治療重癥患者。
這項工作將使他們與NHS合作,為多達20,000名Covid-19重癥監(jiān)護患者和多達15,000名患有輕度疾病癥狀的人提供全基因組測序。
英國基因組學在一份聲明中說,環(huán)境的創(chuàng)造“在基因組研究在協(xié)作藥物發(fā)現(xiàn)和新療法開發(fā)中可以發(fā)揮的作用中“反映了新的篇章”。
在技術(shù)堆棧方面,AWS將為該項目提供對基于云的計算和存儲資源的訪問權(quán)限。同時,Lifebit的技術(shù)將使研究人員能夠運行查詢并分析環(huán)境中包含的數(shù)據(jù),同時還可以幫助研究團隊跨這些大型基因組數(shù)據(jù)集進行協(xié)作。
英國基因組學的首席執(zhí)行官克里斯·威格利(Chris Wigley)說,不僅僅是英國的患者也將從這項工作中受益。
“這全都是對英國及其他地區(qū)患者的影響,他們將受益于英國基因組學對這種可怕大流行的反應的支持。通過更好地理解為什么有些患者對病毒如此嚴重的反應而另一些患者對病毒有輕微的反應,英國基因組學正在幫助支持疫苗和藥物開發(fā)。最終,這將確保對英國Covid患者的治療是個性化,更安全,更有效的?!?Wigley說。
AWS公共部門部門英國和愛爾蘭醫(yī)療保健負責人John Davies補充說:“ Genomics England通過使用AWS,可以為研究人員提供安全,可擴展的云計算資源的訪問權(quán)限,使他們能夠進行研究以更好地了解病毒。并為NHS患者提供更好的結(jié)果和治療?!盵]