德國“毒黃瓜”致病原因通過基因組測序儀被發(fā)現(xiàn)

德國“毒黃瓜”致病事件仍在蔓延，對此事件的發(fā)展各國都十分關注。昨日，Life Technologies公司宣布，使用Ion Personal Genome Machine (PGM?)與德國明斯特大學醫(yī)院合作進行的DNA測序得出的初步數(shù)據(jù)有力地表明，一種新混合型致病大腸桿菌菌株是導致德國致命疫情的原因。

Ion Personal Genome Machine測序儀僅可用于研究用途，該儀器測序以快速著稱，可以在兩個小時內(nèi)完成相對高通量的測序通量，并得到精準的測序結(jié)果。從DNA測序儀獲得的數(shù)據(jù)顯示，典型的基因存在于兩種不同類型的大腸桿菌中：腸聚集性大腸桿菌(EAEC)和腸出血性大腸桿菌(EHEC)。研究人員目前正通過Ion PGM?對結(jié)果進行進一步的數(shù)據(jù)分析和確認。這些結(jié)果有助于了解這種細菌的侵略性并阻止疫情進一步爆發(fā)。致使德國出現(xiàn)疫情的“毒黃瓜”中，經(jīng)過快速全基因組測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)，細菌毒力性狀擁有獨特的組合，使德國經(jīng)過此次疫情爆發(fā)克隆了一種來自不同大腸桿菌致病變型的獨特混合類型。而明斯特大學醫(yī)院的科學家將利用Life Technologies公司實驗室收集的數(shù)據(jù)開發(fā)更好的測試手段，以積極地識別這種表現(xiàn)為腎衰竭和出血性腹瀉的傳染性疾病。

這是自疫情爆發(fā)以來人們第一次能夠詳細研究這種菌株致命性如此之強的原因。為了防止細菌的進一步傳播，Life Technologies公司本周開始向歐洲的實驗室運送其定制的大腸桿菌檢測試劑盒，用于篩選疫情爆發(fā)中心被認為污染的食物。此次歐洲的疫情爆發(fā)已造成17人死亡，1000多人感染。這些試劑盒是第一道防線，用以檢測致病性大腸桿菌是否存在。之后研究人員會使用更細化的試劑盒進行第二輪檢測。未來幾天內(nèi)，一旦測序數(shù)據(jù)分析完畢，Life Technologies公司便將開發(fā)用于檢測德國這種混合型菌株的新定制試劑盒。公司可在一周內(nèi)開發(fā)出定制的化驗劑。運往歐洲的試劑盒是大批Life Technologies公司研制的分子化驗劑的一部分。這些產(chǎn)品可準確檢測出絕大多數(shù)危害人類的病原體。Ion PGM?是一種采用半導體技術的DNA個體化操作基因組測序儀，它可以在短短兩個小時內(nèi)完成高通量和高精確度的DNA測序。用于此次測序的DNA樣本采集自一位患有這種疾病的病人。